Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syde2E9PUP1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syde2E9PUP1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms