Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Piezo1E2JF22 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Piezo1E2JF22 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms