Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
5430403G16RikD3Z5L4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms