Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgfbr3lD3YZZ2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tgfbr3lD3YZZ2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms