Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc6D3YZP9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc6D3YZP9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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