Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc170D3YXL0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc170D3YXL0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms