Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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BC048679D3YXE9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BC048679D3YXE9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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BC048679D3YXE9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BC048679D3YXE9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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