Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmf1B9EKI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tmf1B9EKI3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms