Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf11bB4XVQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf11bB4XVQ1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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