Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cped1B2RX70 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms