Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cfap58B2RW38 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms