Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprbB2RU80 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprbB2RU80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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