Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ythdc2B2RR83 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ythdc2B2RR83 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms