Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbed5B2RPU8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms