Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CK137956B1AYM9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CK137956B1AYM9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms