Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Trabd2bB1ATG9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trabd2bB1ATG9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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