Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2-M5A7VMS3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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