Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Atp8b5A3FIN4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b5A3FIN4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b5A3FIN4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Atp8b5A3FIN4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atp8b5A3FIN4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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