Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc43a3A2AVZ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms