Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl41A2AUC9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms