Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scn3aA2ASI5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scn3aA2ASI5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms