Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GabreA2AMW3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GabreA2AMW3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms