Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AI481877A2ALV5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AI481877A2ALV5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms