Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SetxA2AKX3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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