Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Frmpd1A2AKB4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmpd1A2AKB4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms