Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Frmpd4A2AFR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms