Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm16A2A935 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm16A2A935 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm16A2A935 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm16A2A935 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm16A2A935 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm16A2A935 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm16A2A935 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
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