Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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PtprfA2A8L5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PtprfA2A8L5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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PtprfA2A8L5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PtprfA2A8L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprfA2A8L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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PtprfA2A8L5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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PtprfA2A8L5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtprfA2A8L5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtprfA2A8L5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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PtprfA2A8L5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprfA2A8L5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms