Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prdm2A2A7B5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prdm2A2A7B5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms