Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn2aA0A0J9YTW6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn2aA0A0J9YTW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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