Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv23A0A0A6YWQ1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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