Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KNOP1Q1ED39 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KNOP1Q1ED39 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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