Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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GTF3C1Q12789 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
GTF3C1Q12789 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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