Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt16Q9Z2K1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt16Q9Z2K1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms