Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl27Q9Z1X0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl27Q9Z1X0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms