Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clic1Q9Z1Q5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms