Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms