Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bp5Q9Z131 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Sh3bp5Q9Z131 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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Sh3bp5Q9Z131 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Sh3bp5Q9Z131 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Sh3bp5Q9Z131 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Sh3bp5Q9Z131 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bp5Q9Z131 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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