Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stau1Q9Z108 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms