Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nme4Q9WV84 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nme4Q9WV84 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms