Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms