Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lhx9Q9WUH2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lhx9Q9WUH2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms