Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms