Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms