Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MthfrQ9WU20 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MthfrQ9WU20 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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MthfrQ9WU20 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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MthfrQ9WU20 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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MthfrQ9WU20 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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MthfrQ9WU20 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MthfrQ9WU20 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms