Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Skp1Q9WTX5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Skp1Q9WTX5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms