Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp6ap1Q9R1Q9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms