Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms