Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trex2Q9R1A9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trex2Q9R1A9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms