Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lamc3Q9R0B6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lamc3Q9R0B6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms